當智慧齒因沒有足夠空間長出來而令其長出於錯誤位置時，便形成阻生智慧齒。 因為智慧齒的牙冠會覆蓋牙的牙齦及牙齦間私藏的食物殘渣和細菌，病人自己是無法妥善清潔的。這些無法清潔的食物和細菌會導致 智慧齒及相鄰的牙齒出現蛀牙，令牙周組織容易發炎（智慧齒冠周炎）。 給患者帶來智慧齒牙肉腫痛、口腔散發異味、下顎淋巴的腫脹，更甚至張口困難、吞嚥的時候會感到疼痛。為避免引發各種口腔疾病，牙醫會建議拔除阻生智慧齒。
蛀牙風險增加：阻生智慧齒往往難以清潔，容易累積食物殘渣和細菌，有機會令到智慧齒及相鄰的牙齒出現蛀牙。

牙肉腫痛：阻生智慧齒難以清潔，導致附近的牙齦感染或牙周病的發生，稱為 “牙冠周炎 Peri-coronitis”。感染可能會導致牙肉紅腫、脹痛、口臭和膿液排出等症狀。

牙齒移位：阻生智慧齒可能會對周圍的牙齒施加壓力，導致牙齒移位或擠壓。
囊腫形成：在某些情況下，阻生智慧齒周圍可能形成囊腫。囊腫是一種液體或固體的腫塊，阻生智慧齒某些個案會發展成為水囊(Dentigerous Cyst) 甚至入侵性囊腫(Odontogenic Keratocyst)。可能導致疼痛、腫脹和面部腫大，屆時病人可能需要大範圍截取牙骨才能治癒。