如果传统根管治疗未能完全清除牙齿已感染的坏死牙髓组织，患者或有需要接受根尖手术，是保留牙齿的最后手段。牙医需要透过显微镜进行手术，精细地将受感染坏死的根尖切除，并放置根端填充物防止细菌进入，以保留牙齿。患者在接受根尖手术前应由牙医先作检查及诊断，作出评估是否有需要接受手术治疗。