当智慧齿因没有足够空间长出来而令其长出于错误位置时，便形成阻生智慧齿。 因为智慧齿的牙冠会覆盖牙的牙龈及牙龈间私藏的食物残渣和细菌，病人自己是无法妥善清洁的。这些无法清洁的食物和细菌会导致智慧齿及相邻的牙齿出现蛀牙，令牙周组织容易发炎（智慧齿冠周炎）。 给患者带来智慧齿牙肉肿痛、口腔散发异味、下颚淋巴的肿胀，更甚至张口困难、吞咽的时候会感到疼痛。为避免引发各种口腔疾病，牙医会建议拔除阻生智慧齿。

蛀牙风险增加：阻生智慧齿往往难以清洁，容易累积食物残渣和细菌，有机会令到智慧齿及相邻的牙齿出现蛀牙。

牙肉肿痛：阻生智慧齿难以清洁，导致附近的牙龈感染或牙周病的发生，称为“牙冠周炎Peri-coronitis”。感染可能会导致牙肉红肿、胀痛、口臭和脓液排出等症状。

牙齿移位：阻生智慧齿可能会对周围的牙齿施加压力，导致牙齿移位或挤压。
囊肿形成：在某些情况下，阻生智慧齿周围可能形成囊肿。囊肿是一种液体或固体的肿块，阻生智慧齿某些个案会发展成为水囊(Dentigerous Cyst) 甚至入侵性囊肿(Odontogenic Keratocyst)。可能导致疼痛、肿胀和面部肿大，届时病人可能需要大范围截取牙骨才能治愈。